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Temps de simulation long
by Stephanie MAHEVAS 22 Aug '12

22 Aug '12

Eric, j'ai l'impression que la duree de simulation est plus longue qu'avant. Je n'ai pas d'ordre de grandeur quantitatif car je n'ai pas osé relancer la version antérieure aux corrections des caches... Puis-je lancer la 4.1.0.2 sans que cela ait d'incidence sur la database4? steph -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) Tel: (33) 2 40 37 41 81 Fax: (33) 2 40 37 40 75 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

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remplissage effectifs initiaux
by Stephanie MAHEVAS 22 Aug '12

22 Aug '12

Eric je n'arrive ni à importer ni à copier des valeurs depuis un fichier csv dans l'interface de saisie des effectifs initiaux. Peux-tu regarder ca rapidement car c'est quelque peu bloquant....? merci stephanie -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) Tel: (33) 2 40 37 41 81 Fax: (33) 2 40 37 40 75 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

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semantique des groupes dans matrice de croissance
by Stephanie MAHEVAS 21 Aug '12

21 Aug '12

Eric, dans la base de Fabian, la matrice de croissance de la langoustine a une drole de tete...les groupes ne sont pas ordonnés par ordre croissant de 0 à 24 comme ça devrait etre le cas (et comme c'est le cas pour le merlu dans la même base). Peux-tu regarder stp d'ou ça vient ? merci stephanie -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) Tel: (33) 2 40 37 41 81 Fax: (33) 2 40 37 40 75 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

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Editions site Web non prises en compte
by Stephanie MAHEVAS 20 Aug '12

20 Aug '12

Bonjour je viens de mettre à jour la page nouvelle du site ISIS (avec mon identifiant et en sauvegardant mes ajouts) mais elles ne sont pas visibles... Quelqu'un peut-il me dire ce qui ne va pas??? Merci Stephanie -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) Tel: (33) 2 40 37 41 81 Fax: (33) 2 40 37 40 75 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

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[ANN] - IsisFish 4.1.0.3 released
by forge.codelutin.com Release Notification 10 Aug '12

10 Aug '12

The IsisFish team is pleased to announce the isis-fish-4.1.0.3 release! Simulateur de pecherie complexe. Documentation of the project can be found here: http://maven-site.forge.codelutin.com/isis-fish Changes ------- Changes in this version include: New features: o Make TimeStep type managed by MatrixSemanticMapper Issue: 1390. Thanks to Eric Chatellier. Resolved by echatellier. o Add new variable tab for population Issue: 1389. Thanks to Eric Chatellier. Resolved by echatellier. Fixed Bugs: o Can't open database in offline mode Issue: 1388. Thanks to Eric Chatellier. Resolved by echatellier. o Script are compiled using default encoding Issue: 1395. Thanks to Eric Chatellier. Resolved by echatellier. o When using statistics, if an exception occurs, it's masked by another one Issue: 1393. Thanks to Eric Chatellier. Resolved by echatellier. Changes: o Update to nuiton-matrix 2.3 Issue: 1400. Thanks to Eric Chatellier. Resolved by echatellier. Downloads --------- For a manual installation, you can download files here: http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/files * isis-fish-4.1.0.3-bin.zip - http://forge.codelutin.com/attachments/download/422 Maven artifacts --------------- Artifacts are deployed in nuiton maven repository http://maven.nuiton.org/other-releases/ Have fun! -IsisFish team

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pour la calibration
by Stephanie MAHEVAS 03 Aug '12

03 Aug '12

Loic, au cas ou tu ne l'aurais pas repere sur le site voici un tutoriel qui devrait etre utile pour faire le script de calibration de q avec l'algo d'optimisation http://www.isis-fish.org/v4/user/tutorials/simulationPlan.html a+ steph -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) Tel: (33) 2 40 37 41 81 Fax: (33) 2 40 37 40 75 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

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AS
by Paul MARCHAL 30 Jul '12

30 Jul '12

Bonjour, Je me lance dans une AS, où je souhaite modifier des paramètres de mes règles de gestion. Je crois me souvenir de notre dernière réunion ISIS-Fish que la v4 permettait de le faire facilement via l'interface, mais je ne me souviens plus de la manière de procéder. J'ai jeté un coup d'oeil au tutoriel, mais je crois qu'il n'est pas à jour. Quelqu'un pourrait il me faire un rappel rapide de laprocédure à suivre? Merci! Paul -- Paul Marchal IFREMER DOP/DHMMN Laboratoire Ressources Halieutiques de Boulogne/mer Boulogne/mer Fishery Resources Laboratory http://wwz.ifremer.fr/manchemerdunord 150, Quai Gambetta BP 699 62321 Boulogne sur mer FRANCE Tel: (+33) 321 99 56 86 Fax: (+33) 321 99 56 01 Mail: paul.marchal(a)ifremer.fr

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ISIS, R et FLR (encore et encore)
by Paul MARCHAL 24 Jul '12

24 Jul '12

Bonjour, Voici un nouveau problème qui apparaît en lançant R depuis ISIS. La rèble utilisée La règle (XSA, attachée ici) crée entre autres choses un objet, NauxAges, de type (RDataFrame). Le problème survient lorsque l'on veut récupérer les informations contenues dans cet objet avec "get"(e.g. ligne 374 de XSA). Cela ne marche pas, alors que cela fonctionnait très bien avec la v3. Je vous joins le fichier "debug". Merci pour vos lumières Paul -- Paul Marchal IFREMER DOP/DHMMN Laboratoire Ressources Halieutiques de Boulogne/mer Boulogne/mer Fishery Resources Laboratory http://wwz.ifremer.fr/manchemerdunord 150, Quai Gambetta BP 699 62321 Boulogne sur mer FRANCE Tel: (+33) 321 99 56 86 Fax: (+33) 321 99 56 01 Mail: paul.marchal(a)ifremer.fr

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Changement des effectifs initiaux
by Jessica Andre 24 Jul '12

24 Jul '12

Bonjour, Quelle est la commande pour accéder (et accessoirement changer) les effectif initiaux ?! Dans l'API, j'ai trouvé dans SimulationParameterImpl un numbers qui est une Map. Je sais pas trop comment l'utiliser, et surtout je ne vois pas de fonction Set... Merci d'avance ! Jess P.S. Merci Eric pour ta réponse a mon dernier email ! *************************************************************************************** Dr Jessica André Junior Research Fellow Wild Fisheries Program-Fisheries Aquaculture & Coasts (FAC) Institute for Marine and Antarctic Studies (IMAS) University of Tasmania, Private Bag 49 Hobart, TAS 7001, Australia Ph: (03) 6227 7284 /Int: +61 3 6227 7284 Fax: (03) 6227 8035 /Int: +61 3 6227 8035 Email: Jessica.Andre(a)utas.edu.au Web: http://fcms.its.utas.edu.au/scieng/mrl/pagedetails.asp?lPersonId=3177 `·.,, ><(((º> `·.,, ><(((º> `·.,, ><(((º>

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ISIS-Fish, R et FLR: le retour
by Paul MARCHAL 19 Jul '12

19 Jul '12

Bonjour, J'ai un nouvel ordinateur 64 bits, sur lequel j'ai installé la version 4.1.0.1 d'ISIS-Fish. Les programmes utilisés font appel à R et FLR. R est initialisé correctement lorsque je lance l'appli ISIS pour 64 bits, mais le problème est que FLR ne peut être lancé que sur des applis en 32 bits. Du coup, j'ai relancé ISIS en 32 bits, mais cette fois R ne s'initialise pas. Pourtant, le R_HOME est correct (et pointe la version 32 bits de R). Je vous envoie le debug qui m'est envoyé. Le même problème se pose sur l'ordinateur d'Youen. Merci pour vos suggestions Bon après-midi Paul -- Paul Marchal IFREMER DOP/DHMMN Laboratoire Ressources Halieutiques de Boulogne/mer Boulogne/mer Fishery Resources Laboratory http://wwz.ifremer.fr/manchemerdunord 150, Quai Gambetta BP 699 62321 Boulogne sur mer FRANCE Tel: (+33) 321 99 56 86 Fax: (+33) 321 99 56 01 Mail: paul.marchal(a)ifremer.fr

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