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Bonjour
by rakotoarimalala mbolanantenaina 03 May '13

03 May '13

Bonjour, j'aimerai utiliser le logiciel Isis-fish pour mon travail de mémoire de fin d'étude, mon problème est que je n'arrive pas à télécharger le logiciel source à partir du lien habituel et je demande votre bienveillance de bien vouloir me l'envoyer à mon adresse mail, s'il vous plait au "mbolanantenaina891(a)gmail.com"

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Ressources Isis-fish
by Postmaster ISIS-Fish 31 Mar '13

31 Mar '13

Amis utilisateurs d'ISIS-Fish, Ce mail automatique, envoyé tous les 3 mois sur les listes de diffusions du projet, a pour but de vous rappeler toutes les ressources disponibles pour toutes vos éventuelles questions et problèmes. Documentation et manuel utilisateurs ------------------------------------ La documentation d'ISIS-Fish est présente sur le site à cette adresse : http://isis-fish.org/v4/index.html. N'hésitez pas à nous remonter les parties qui ne sont pas claires ou les parties qui ne sont pas à jour, le logiciel évoluant, certaines parties de la documentation sont peut-être obsolètes. Questions et FAQ ---------------- Vous pouvez poser vos questions à cette même liste de diffusion en envoyant un mail à isis-fish-users(a)list.isis-fish.org. Toutes les personnes abonnées le recevront et pourront répondre à vos éventuelles questions. N'oubliez pas, avant de poser votre question, de rechercher parmis les archives de la liste (http://list.isis-fish.org/pipermail/isis-fish-users/) votre question a peut-être déjà été posée. Les questions les plus fréquemment posées sont regroupées sur le site sur la page FAQ : http://isis-fish.org/v4/user/FAQ.html Forge, rapports de bug, suivi des évolutions -------------------------------------------- Si vous rencontrez un bug, vous pouvez vérifier sur la forge ISIS-Fish (http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/issues) si nous en avons déjà connaissance. Si nous n'en avons pas connaissance, vous pouvez nous rapporter le bug, nous l'intègrerons dans la liste des évolutions prévues (http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/roadmap) Pour rapporter un bug (ou une demande d'évolution), donnez nous le maximum de détails sur ce bug (comment vous l'avez obtenu ? votre base, vos paramètres et le fichier debug.txt). Plus nous avons d'informations, plus nous pourrons vous aider simplement. L'équipe ISIS-Fish

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copier des simulations depuis caparmor
by Loic GASCHE 06 Feb '13

06 Feb '13

Bonjour, Je souhaiterais télécharger des simulations qui sont dans mon isis-tmp sur caparmor. La doc ISIS dit de les copier avec la commande : cp *-result.zip /home/navidad/partages/echange/sigrid si on souhaite les mettre sur un disque d'échange. Est-il possible de les télécharger directement sur son pc ? Si ce n'est pas possible, où trouver le disque d'échange (je n'ai pas trouvé de "navidad") et comment l'utiliser ? Merci d'avance ! Loïc

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Rôle et fonctionnement des groupes de facteurs dans les AS d'ISIS ?
by Loic GASCHE 01 Feb '13

01 Feb '13

Bonjour, Je suis allé voir dans le manuel sur le site ISIS mais je n'ai pas trouvé d'infos sur ce qu'ISIS fait exactement quand on choisit de mettre deux facteurs dans un même groupe lors d'une AS. Puis-je trouver l'info quelque part (il me semble qu'on en avait parlé lors de l'atelier utilisateurs ISIS) ? Ou serait-il possible d'avoir à nouveau une courte explication ? Loïc

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relancer des simus stoppées sur caparmor ?
by Loic GASCHE 29 Jan '13

29 Jan '13

Bonjour, Je ne sais pas pourquoi mais des simus que j'avais lancé sur caparmor ont arrêté de tourner... Y-a-t-il un moyen de savoir pourquoi ? Et éventuellement de faire en sorte qu'elles recommencent à tourner ? Sur le site isis il est dit qu'on peut utiliser "qsub" pour relancer des simus d'un plan mais je ne pense pas que ça résolve mon problème... Loïc

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PB avec les groupes de facteurs continus ?
by Loic GASCHE 28 Jan '13

28 Jan '13

Bonjour, J'ai l'impression qu'il y a un problème avec les groupes de facteurs continus, qui ne fonctionnent pas comme ils le devraient. Il semblerait que lorsque je fais une AS avec des paramètres regroupés (par exemple 2 groupes de 2) les sorties de l'AS ne sont pas impactées par les variations de la valeur des paramètres, alors que les valeurs prises par les paramètres d'entrée varient dans le RData. A l'inverse si je me passe des groupes et fais mon AS sur les 4 mêmes paramètres pris indépendamment, j'ai bien un impact notable sur les sorties du modèle. Vous pourriez jeter un coup d’œil là-dessus les lutins ? Loïc

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[ANN] - IsisFish 4.2.1.1 released
by forge.codelutin.com Release Notification 28 Jan '13

28 Jan '13

The IsisFish team is pleased to announce the isis-fish-4.2.1.1 release! Simulateur de pecherie complexe. Documentation of the project can be found here: http://maven-site.forge.codelutin.com/isis-fish Changes ------- Changes in this version include: Fixed Bugs: o Factor group factor do not impact simulation output Issue: 1937. Thanks to Eric Chatellier. Resolved by echatellier. o NPE when initializing nimbus on caparmor Issue: 1916. Thanks to Eric Chatellier. Resolved by echatellier. o Add option to change mapped result's matrix vector implementation class Issue: 1626. Thanks to Eric Chatellier. Resolved by echatellier. Downloads --------- For a manual installation, you can download files here: http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/files * isis-fish-4.2.1.1-bin.zip - http://forge.codelutin.com/attachments/download/576 Maven artifacts --------------- Artifacts are deployed in nuiton maven repository http://maven.nuiton.org/other-releases/ Have fun! -IsisFish team

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pb import de base
by Stephanie MAHEVAS 22 Jan '13

22 Jan '13

Bonjour je n'arrive pas à importer une base.... merci stephanie -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) Tel: (33) 2 40 37 41 81 Fax: (33) 2 40 37 40 75 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

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Dire à ISIS de recommencer à télécharger des simus ?
by Loic GASCHE 15 Jan '13

15 Jan '13

Bonjour, Mon ordi ayant planté pendant qu'ISIS téléchargeait des simus depuis caparmor, le téléchargement s'est arrêté. Y-a-t-il un moyen de dire à ISIS de reprendre le téléchargement ou devrai-je télécharger les simus manuellement une fois qu'elles auront toutes fini de tourner ? Serait-il possible pour moi d'accéder à caparmor depuis un autre ordi (un qui ne plante pas, comme par exemple le serveur de Steph) et de télécharger les simus sur mon disque externe ainsi que le RData, pour éventuellement les mettre sur mon PC après si j'en ai besoin ? Loïc

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pb AS caparmor ?
by Loic GASCHE 14 Jan '13

14 Jan '13

Bonjour, J'ai lancé une AS sur caparmor vendredi, et aucun résultat n'a été téléchargé sur mon ordinateur. Comme celui-ci à de plus planté pendant le weekend et que j'ai du tout redémarrer difficile de savoir ce qui n'a pas marché. Ce que je peux dire est que toutes les simus avaient selon ISIS été uploadées sur caparmor et étaient en attente de téléchargement mais rien ne s'est passé. Le problème est que je n'arrive même pas à savoir si les simus ont tourné ou non sur caparmor, afin que je puisse tenter de les récupérer manuellement, ou si je dois tout relancer. On dirait que dans mon dossier lgasche sur caparmor j'ai un mélange des dernières AS que j'ai voulu faire tourner et de vieilles AS qui n'ont pas été supprimées. Dans lgasche\isis-tmp je retrouve des fichiers .bsh et .txt de mes simus et quand j'ouvre un .txt voilà ce que j'ai : service7>28% cat simulation-as_HCR_complete_10ans_AS_2013-01-11-18-46_9999-outpu t.txt INFO [main] (IsisFish.java:125) main - Starting Isis-Fish 4.2.1.0 with args : [ --option, launch.ui, false, --option, perform.vcsupdate, false, --option, perfor m.migration, false, --option, perform.cron, false, --simulateRemotellyWithPreScr ipt, as_HCR_complete_10ans_AS_2013-01-11-18-46_9999, /home1/caparmor/lgasche/isi s-tmp/simulation-as_HCR_complete_10ans_AS_2013-01-11-18-46-preparation.zip, /hom e1/caparmor/lgasche/isis-tmp/simulation-as_HCR_complete_10ans_AS_2013-01-11-18-4 6_9999-result.zip, /home1/caparmor/lgasche/isis-tmp/simulation-as_HCR_complete_1 0ans_AS_2013-01-11-18-46_9999-prescript.bsh] INFO [main] (IsisFish.java:126) main - Date: 11/01/13 20:53 INFO [main] (IsisFish.java:127) main - Java version: 1.7.0_10-b18, Java HotSpot (TM) 64-Bit Server VM INFO [main] (IsisFish.java:128) main - System arch: amd64 INFO [main] (IsisFish.java:129) main - R_HOME: /appli/R/2.15.0-gnu-4.3/lib64/R, R.type: jni INFO [main] (IsisFish.java:130) main - PATH: /appli/intel/itac/8.0.0.011/bin:/a ppli/intel/impi/4.0.0.028/bin64:/appli/intel/Compiler/11.1/073/bin/intel64:/bin: /usr/bin:/usr/local/bin:/usr/bin/X11:/usr/X11R6/bin:/usr/games:/opt/c3/bin:/usr/ lib/mit/bin:/usr/lib/mit/sbin:/opt/gnome/bin:.:/opt/sgi/sbin:/opt/sgi/bin:/sbin: /bin:/usr/sbin:/usr/bin:/usr/ucb:/usr/local/bin:/usr/bin/X11:/export/home/servic es/bin:.:/home1/caparmor/lgasche:/usr/pbs/bin:/usr/pbs/sbin:/sbin:/bin:/usr/sbin :/usr/bin:/usr/ucb:/usr/local/bin:/usr/bin/X11:/export/home/services/bin:.:/home 1/caparmor/lgasche:/usr/pbs/bin:/usr/pbs/sbin INFO [main] (IsisFish.java:131) main - java.library.path: jri64 Exception in thread "main" java.lang.NullPointerException at sun.font.FontConfigManager.getFontConfigFont(FontConfigManager.java:3 52) at sun.awt.X11FontManager.getFontConfigFUIR(X11FontManager.java:817) at sun.font.FontUtilities.getFontConfigFUIR(FontUtilities.java:488) at javax.swing.plaf.nimbus.NimbusDefaults.<init>(NimbusDefaults.java:138 ) at javax.swing.plaf.nimbus.NimbusLookAndFeel.<init>(NimbusLookAndFeel.ja va:100) at sun.reflect.NativeConstructorAccessorImpl.newInstance0(Native Method) at sun.reflect.NativeConstructorAccessorImpl.newInstance(NativeConstruct orAccessorImpl.java:57) at sun.reflect.DelegatingConstructorAccessorImpl.newInstance(DelegatingC onstructorAccessorImpl.java:45) at java.lang.reflect.Constructor.newInstance(Constructor.java:525) at java.lang.Class.newInstance0(Class.java:372) at java.lang.Class.newInstance(Class.java:325) at javax.swing.UIManager.setLookAndFeel(UIManager.java:580) at fr.ifremer.isisfish.IsisFish.initLookAndFeel(IsisFish.java:197) at fr.ifremer.isisfish.IsisFish.main(IsisFish.java:146) On dirait qu'il y a un problème mais je ne sais pas si ça peut avoir bloqué les simus ou non... Vu la petite taille de isis-tmp je dirais que les simus n'ont pas tourné, mais si quelqu'un pouvait confirmer et avait une idée de la cause je suis preneur... Loïc

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