- Isis-fish-users - mailman.cloud.codelutin.com

Re: [Isis-fish-users] pb 32-64 bits
by Bastien Preuss 12 Mar '12

12 Mar '12

Voici le contenu de mon isifish.bat @echo off echo [Script] Isis starting... C:\Program Files (x86)\Java\jdk1.6.0_24\java -Xmx1024M -Djava.library.path=jri -DR.type=jni -jar isis-fish-3.3.0.9.jar %1 %2 %3 %4 %5 %6 %7 %8 %9 > debug.txt 2>&1 -----Message d'origine----- De : isis-fish-users-bounces(a)list.isis-fish.org [mailto:isis-fish-users-bounces@list.isis-fish.org] De la part de Eric Chatellier Envoyé : lundi 12 mars 2012 22:24 À : isis-fish-users(a)list.isis-fish.org Objet : Re: [Isis-fish-users] pb 32-64 bits Le 12/03/2012 12:19, Bastien Preuss a écrit : > Je rencontre toujours le pb sur ma machine avec 32 et 64 bits. > Pour récapituler : > > J'ai dans le path : %R_HOME%\bin\i386; %JAVA_HOME%\bin > Dans la variable R_HOME : C:\Progam Files(x86)\R\R-2.9.2 > Dans la variable JAVA_HOME : C:\Program Files(x86)\Java\jrk1.6.0_24 Ca m'a l'air bon. Il est possible qu'il y ait un autre Java sur le PC pour qu'il en trouve un autre dans ce cas. Sinon, une autre solution, dans le fichier isisfish.bat tu peux remplacer "java" par: "C:\Program Files(x86)\Java\jdk1.6.0_24\java" il n'y aura plus de doute. -- Éric Chatellier <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com _______________________________________________ Isis-fish-users mailing list Isis-fish-users(a)list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users

1 0

Re: [Isis-fish-users] pb 32-64 bits
by Bastien Preuss 12 Mar '12

12 Mar '12

Je remplace uniquement le "java" au début de la dernière ligne? Ou toutes les fois où "java" apparait? Parce que là Isis ne démarre m^me plus ! -----Message d'origine----- De : isis-fish-users-bounces(a)list.isis-fish.org [mailto:isis-fish-users-bounces@list.isis-fish.org] De la part de Eric Chatellier Envoyé : lundi 12 mars 2012 22:24 À : isis-fish-users(a)list.isis-fish.org Objet : Re: [Isis-fish-users] pb 32-64 bits Le 12/03/2012 12:19, Bastien Preuss a écrit : > Je rencontre toujours le pb sur ma machine avec 32 et 64 bits. > Pour récapituler : > > J'ai dans le path : %R_HOME%\bin\i386; %JAVA_HOME%\bin > Dans la variable R_HOME : C:\Progam Files(x86)\R\R-2.9.2 > Dans la variable JAVA_HOME : C:\Program Files(x86)\Java\jrk1.6.0_24 Ca m'a l'air bon. Il est possible qu'il y ait un autre Java sur le PC pour qu'il en trouve un autre dans ce cas. Sinon, une autre solution, dans le fichier isisfish.bat tu peux remplacer "java" par: "C:\Program Files(x86)\Java\jdk1.6.0_24\java" il n'y aura plus de doute. -- Éric Chatellier <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com _______________________________________________ Isis-fish-users mailing list Isis-fish-users(a)list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users

2 1

Re: [Isis-fish-users] pb 32-64 bits
by Bastien Preuss 12 Mar '12

12 Mar '12

Je rencontre toujours le pb sur ma machine avec 32 et 64 bits. Pour récapituler : J'ai dans le path : %R_HOME%\bin\i386; %JAVA_HOME%\bin Dans la variable R_HOME : C:\Progam Files(x86)\R\R-2.9.2 Dans la variable JAVA_HOME : C:\Program Files(x86)\Java\jrk1.6.0_24 -----Message d'origine----- De : isis-fish-users-bounces(a)list.isis-fish.org [mailto:isis-fish-users-bounces@list.isis-fish.org] De la part de Eric Chatellier Envoyé : lundi 12 mars 2012 21:20 À : isis-fish-users(a)list.isis-fish.org Objet : Re: [Isis-fish-users] pb 32-64 bits Le 12/03/2012 11:08, bastien preuss a écrit : > Sur un de mes autres ordi où ça ne fonctionne pas non plus et qui est en 32 > bits le message du debug dit : > > Cannot find JRI native library! > Please make sure that the JRI native library is in a directory listed in > java.library.path. > > java.lang.UnsatisfiedLinkError: C:\Documents and > Settings\bpreuss\Desktop\isis-fish-3.3.0.8\jri\jri.dll > > donc est-ce que là aussi le %Java_HOME%\bin est nécessaire? Non, là c'est différent. Soit le R_HOME n'est pas défini. Soit le dossier "bin" de R n'est pas dans le path. http://www.isis-fish.org/v4/user/installationr.html#Windows -- Éric Chatellier <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com _______________________________________________ Isis-fish-users mailing list Isis-fish-users(a)list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users

2 1

pb 32-64 bits
by Bastien Preuss 12 Mar '12

12 Mar '12

Bonjour, Jai un soucis avec une AS qui ne se lance pas, dans le message derreur, il semble y avoir un pb de fichier .dll en 32 bits alors que ma machine est en 64 Je mets le debug en pièce jointe, si quelquun saurait comment résoudre le pb. Pour précision jessaie de tout utiliser en version 32 bits car R 2.9.2 nexiste quen 32 bits. Merci. Bastien Bastien Preuss Doctorant (PhD Student) IFREMER - IRD - Université de Nouvelle-Calédonie 101 Promenade Roger Laroque BP A5 98848 Noumea cedex New-Caledonia Tel: (+687) 260 723 P afin de contribuer au respect de l'environnement, merci de n'imprimer ce mail qu'en cas de nécessité

3 6

Ressources Isis-fish
by Postmaster ISIS-Fish 01 Mar '12

01 Mar '12

Amis utilisateurs d'ISIS-Fish, Ce mail automatique, envoyé tous les 3 mois sur les listes de diffusions du projet, a pour but de vous rappeler toutes les ressources disponibles pour toutes vos éventuelles questions et problèmes. Documentation et manuel utilisateurs ------------------------------------ La documentation d'ISIS-Fish est présente sur le site à cette adresse : http://isis-fish.org/v4/index.html. N'hésitez pas à nous remonter les parties qui ne sont pas claires ou les parties qui ne sont pas à jour, le logiciel évoluant, certaines parties de la documentation sont peut-être obsolètes. Questions et FAQ ---------------- Vous pouvez poser vos questions à cette même liste de diffusion en envoyant un mail à isis-fish-users(a)list.isis-fish.org. Toutes les personnes abonnées le recevront et pourront répondre à vos éventuelles questions. N'oubliez pas, avant de poser votre question, de rechercher parmis les archives de la liste (http://list.isis-fish.org/pipermail/isis-fish-users/) votre question a peut-être déjà été posée. Les questions les plus fréquemment posées sont regroupées sur le site sur la page FAQ : http://isis-fish.org/v4/user/FAQ.html Forge, rapports de bug, suivi des évolutions -------------------------------------------- Si vous rencontrez un bug, vous pouvez vérifier sur la forge ISIS-Fish (http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/issues) si nous en avons déjà connaissance. Si nous n'en avons pas connaissance, vous pouvez nous rapporter le bug, nous l'intègrerons dans la liste des évolutions prévues (http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/roadmap) Pour rapporter un bug (ou une demande d'évolution), donnez nous le maximum de détails sur ce bug (comment vous l'avez obtenu ? votre base, vos paramètres et le fichier debug.txt). Plus nous avons d'informations, plus nous pourrons vous aider simplement. L'équipe ISIS-Fish

1 0

Récupération résultats simu
by Bastien Preuss 23 Jan '12

23 Jan '12

Bonjour, Petite question, est-il possible de récupérer les résultats dune simulation en dehors dIsis, si je nai pas fais dexport pendant la simulation ? En fait mon souci, est que mon ordinateur nest pas assez puissant pour mouvrir les résultats dans linterface Isis (message derreur : « Java heap space, Out of Memory »). Mais quil nest pas non plus assez puissant pour faire tourner cette même simu avec une demande dexport des résultats (opération qui semble fortement solliciter la RAM). Du coup jaimerais savoir comment faire pour visualiser mes résultats de simulation. Merci. Bastien Bastien Preuss Doctorant (PhD Student) IFREMER - IRD - Université de Nouvelle-Calédonie 101 Promenade Roger Laroque BP A5 98848 Noumea cedex New-Caledonia Tel: (+687) 260 723 P afin de contribuer au respect de l'environnement, merci de n'imprimer ce mail qu'en cas de nécessité

2 1

[ANN] - IsisFish 4.0.0.2 released
by forge.codelutin.com Release Notification 12 Jan '12

12 Jan '12

The IsisFish team is pleased to announce the isis-fish-4.0.0.2 release! Simulateur de pecherie complexe. Documentation of the project can be found here: http://maven-site.forge.codelutin.com/isis-fish Changes ------- Changes in this version include: New features: o Update to h2 1.3.163 Issue: 652. Thanks to Eric Chatellier. Resolved by echatellier. o Update to topia 2.6.5 Issue: 675. Thanks to Eric Chatellier. Resolved by echatellier. o Update to hibernate 3.6.9.Final Issue: 676. Thanks to Eric Chatellier. Resolved by echatellier. o Update to nuiton-utils 2.4.2 Issue: 674. Thanks to Eric Chatellier. Resolved by echatellier. Fixed Bugs: o Equation context value is computed from defaultValue Issue: 719. Thanks to Eric Chatellier. Resolved by echatellier. o labels erronés lors de l'affichage des résultats sommés par an Issue: 392. Thanks to Jean Couteau. Resolved by echatellier. o Can't found factor name in simulation context Issue: 716. Thanks to Eric Chatellier. Resolved by echatellier. Downloads --------- For a manual installation, you can download files here: http://forge.codelutin.com/projects/files/isis-fish * isis-fish-4.0.0.2-bin.zip - http://forge.codelutin.com/attachments/download/262 Maven artifacts --------------- Artifacts are deployed in nuiton maven repository http://maven.nuiton.org/other-releases/ * http://maven.nuiton.org/other-releases/fr/ifremer/isis-fish/4.0.0.2/THIRD-P… * http://maven.nuiton.org/other-releases/fr/ifremer/isis-fish/4.0.0.2/isis-fi… * http://maven.nuiton.org/other-releases/fr/ifremer/isis-fish/4.0.0.2/isis-fi… * http://maven.nuiton.org/other-releases/fr/ifremer/isis-fish/4.0.0.2/isis-fi… * http://maven.nuiton.org/other-releases/fr/ifremer/isis-fish/4.0.0.2/isis-fi… * http://maven.nuiton.org/other-releases/fr/ifremer/isis-fish/4.0.0.2/isis-fi… * http://maven.nuiton.org/other-releases/fr/ifremer/isis-fish/4.0.0.2/isis-fi… * http://maven.nuiton.org/other-releases/fr/ifremer/isis-fish/4.0.0.2/isis-fi… * http://maven.nuiton.org/other-releases/fr/ifremer/isis-fish/4.0.0.2/THIRD-P… Have fun! -IsisFish team

1 0

Animation Reseau ISIS-Fish - 5 et 6 Décembre 2011
by Stephanie MAHEVAS 03 Jan '12

03 Jan '12

Bonjour à tous suite au message de juin dernier, je vous propose d'organiser la réunion N°2 du réseau ISIS-fish. Elle se tiendra sur 2 jours les *5 et 6 décembre à Nantes*. Pour faciliter l'organisation, *merci de me confirmer votre présence avant le 7 octobre*. L'ordre du jour sera le suivant *Lundi 5 décembre* 10h-18h (salle 8) - Présentation de la dernière version d'ISIS-Fish + Visio avec Dominique en Nouvelle Calédonie - Présentations des applications en cours application Manche poissons plats (Paul et Loic) application Golfe de Gascogne anchois (Sigrid et Lionel) application Golfe de Gascogne Merlu-langoustine (Michel,Stephanie et Sonia) application Bouche de Bonifaccio (Delphine) application Banuyls (Chirine, Marion) application Nouvelle-Caledonie (Bastien) application Tasmanie (Jessica et Philippe) application Nouvelle-Zélande (Paul) application Canada- Golfe du St Laurent (Benoit, Stéphanie) autres?? *Mardi 6 décembre *9h-16h (salle 8) - Fin des présentations sur les applications* * - Présentations des nouvelles librairies VPA et Harvest Control Rule (Paul) RUM (Youen) Analyse de sensibilite (Steph) - Discussions, projets à venir, amélioration des la calibration couplage avec d'autres modèles application golfe de Gascogne sole - Financement - Fonctionnement du réseau et formations Si vous souhaitez ajouter des points à l'ordre du jour merci de me l'indiquer. Merci de diffuser cette annonce autour de vous car c'est aussi l'occasion pour des gens intéressés de découvrir ISIS-Fish. Bonne journée Stéphanie Stephanie MAHEVAS <Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr> a écrit : > Chers ISIS-Fishiens > > La réunion N°2 du réseau ISIS-fish aura lieu en novembre ou décembre > prochain sur 3 jours à Nantes. Il s'agit d'une réunion d'animation > scientifique et technique autour de ISIS-Fish. > Cette réunion est ouverte à tous (utilisateurs/non utilisateurs) et > doit permettre > > 1. aux utilisateurs/développeurs > > * de mieux se connaitre > * d'échanger sur l'expérience et d'en faire profiter les autres > * de faire le point sur les difficultés et de trouver des solutions > pour y pallier > > 2. aux nouveaux > > * de mieux comprendre ce qu'est ISIS, > * à quoi il sert et > * comment on l'utilise > > 3. de discuter d'une stratégie de réseau interne à l'Ifremer et > externe à l'Ifremer pour développer de nouvelles applications > > L'organisation de la réunion serait la suivante: > Journée 1 : présentation/formation (Modèle, Java, Calibration, AS) > Journée 2 : 1) des dernières évolutions d'ISIS-Fish, 2) différentes > applications en cours, 3) des évolutions à venir, 4) discussion sur le > fonctionnement du réseau > Journée 3 : Travaux pratiques > > Je vous propose un doodle pour bloquer des dates et permettre aux > utilisateurs lointains de s'organiser > http://www.doodle.com/tt33kwzgy7runsfr. > Merci d'utiliser le champ commentaire pour lister vos attentes de > cette réunion. > > Si vous connaissez des personnes potentiellement intéressées, merci de > leur diffuser l'information. > > Bonne journée > Stéphanie > > -- > ...................................................................... > Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) > IFREMER/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) Tel: (33) 2 40 > 37 41 81 Fax: (33) 2 40 37 40 75 o \ o / _ o __| > \ / |__ o _ \ o / o > /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ > / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ > ...................................................................... > _______________________________________________ > Isis-fish-users mailing list > Isis-fish-users(a)list.isis-fish.org > http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users > -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) Tel: (33) 2 40 37 41 81 Fax: (33) 2 40 37 40 75 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

3 10

Re: [Isis-fish-users] Bug au chargement de la région
by Bastien Preuss 03 Jan '12

03 Jan '12

Ok, J'ai une sauvegarde relativement récente, du coup j'ai supprimer les dossiers Isis-database-3 et Isis-built, et j'ai tout réimporté à partir de ma sauvegarde. J'ai perdu quelques simu mais pas plus. Merci Eric. Bonne journée, et bonne année à tous! Bastien -----Message d'origine----- De : isis-fish-users-bounces(a)list.isis-fish.org [mailto:isis-fish-users-bounces@list.isis-fish.org] De la part de Eric Chatellier Envoyé : lundi 2 janvier 2012 19:34 À : isis-fish-users(a)list.isis-fish.org Objet : Re: [Isis-fish-users] Bug au chargement de la région Le 30/12/2011 05:53, Bastien Preuss a écrit : > Oups, > > voici le Debug en question. Je pense que ta base est corrompue :( Si tu n'en a pas de sauvegarde, peux-tu m'envoyer le dossier zipper de la region "non exportée" (directement dans isis-database-3) Je vais tenter de la recuperer. -- Éric Chatellier <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com _______________________________________________ Isis-fish-users mailing list Isis-fish-users(a)list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users

1 0

Bug au chargement de la région
by Bastien Preuss 02 Jan '12

02 Jan '12

Oups, voici le Debug en question. Bastien Bastien Preuss Doctorant (PhD Student) IFREMER - IRD - Université de Nouvelle-Calédonie 101 Promenade Roger Laroque BP A5 98848 Noumea cedex New-Caledonia Tel: (+687) 260 723 P afin de contribuer au respect de l'environnement, merci de n'imprimer ce mail qu'en cas de nécessité

2 1