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Vocabulaire Isis-Fish
by Etienne JOUBERT 09 Feb '22

09 Feb '22

Bonjour à tous, J'espère que vous allez bien et que vous avez passé un agréable week-end. J'ai quelques questions à vous poser, concernant certains termes du volet pêche du simulateur. J'ai essayé de faire des recherches sur leur calcul/définition précise, dans la bibliographie de la communauté sur le site ou dans le FAQ, mais je garde quelques incertitudes. 3 termes me posent problème : la sélectivité, l'accessibilité et le facteur de standardisation. Accepteriez-vous de valider ou corriger mes définitions et méthodes de calcul s'il vous plaît? - La sélectivité : Probabilité d'attraper le poisson en question lors de la pêche (compris entre 0 et 1). Si on se base sur des observations cela revient au nombre de prises de l'espèce étudiée, dans une zone durant une période donnée, divisée par le nombre total de prises dans la zone d'étude pour un engin donné. - L'accessibilité : Probabilité d'attraper le poisson en question par unité d'effort de pêche pour un engin non sélectif (compris entre 0 et 1). Soit le nombre d'individus de l'espèce étudiée, attrapés durant une période de temps et dans une zone donnée, divisé par le nombre d'heures d'activité moyen d'un engin sur la même période et zone. -Le Facteur de standardisation : taux de correction permettant de comparer les différentes activités de pêche (compris entre 0 et 1). Correspond pour chaque engin au temps de pêche minimal parmi les différents engins du modèle divisé par le temps de pêche de l'engin en question. Je vous souhaite une bonne journée et vous remercie d'avance pour votre aide. Bien cordialement, Etienne Joubert

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Ressources Isis-fish
by Postmaster ISIS-Fish 31 Dec '21

31 Dec '21

Amis utilisateurs d'ISIS-Fish, Ce mail automatique, envoyé tous les 3 mois sur les listes de diffusions du projet, a pour but de vous rappeler toutes les ressources disponibles pour toutes vos éventuelles questions et problèmes. Documentation et manuel utilisateurs ------------------------------------ La documentation d'ISIS-Fish est présente sur le site à cette adresse : http://isis-fish.org/index.html. N'hésitez pas à nous remonter les parties qui ne sont pas claires ou les parties qui ne sont pas à jour, le logiciel évoluant, certaines parties de la documentation sont peut-être obsolètes. Questions et FAQ ---------------- Vous pouvez poser vos questions à cette même liste de diffusion en envoyant un mail à isis-fish-users(a)list.isis-fish.org. Toutes les personnes abonnées le recevront et pourront répondre à vos éventuelles questions. N'oubliez pas, avant de poser votre question, de rechercher parmis les archives de la liste (http://list.isis-fish.org/pipermail/isis-fish-users/) votre question a peut-être déjà été posée. Les questions les plus fréquemment posées sont regroupées sur le site sur la page FAQ : http://isis-fish.org/v4/user/FAQ.html Forge, rapports de bug, suivi des évolutions -------------------------------------------- Si vous rencontrez un bug, vous pouvez vérifier sur la forge ISIS-Fish (http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/issues) si nous en avons déjà connaissance. Si nous n'en avons pas connaissance, vous pouvez nous rapporter le bug, nous l'intègrerons dans la liste des évolutions prévues (http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/roadmap) Pour rapporter un bug (ou une demande d'évolution), donnez nous le maximum de détails sur ce bug (comment vous l'avez obtenu ? votre base, vos paramètres et le fichier debug.txt). Plus nous avons d'informations, plus nous pourrons vous aider simplement. L'équipe ISIS-Fish

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Individus contribuant au rectrutement
by dedah.ahmed-babou＠ird.fr 10 Dec '21

10 Dec '21

Bonjour à tous, Est-ce que quelqu'un(e) pourrait m'aider a avoir un bout de code qui permettrait de récupérer, dans l'éditeur de l'équation du recrutement, le nombre d'individus d'âge 2 à la saison de reproduction qui s'étale sur deux mois (ce sont les individus qui seront utilisés pour générer un recrutement suivant une relation stock-recrutement). Merci par avance.

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récupérer la liste des cellules des zones ISIS
by Sigrid LEHUTA 09 Dec '21

09 Dec '21

Bonjour, y a t'il un moyen de récuperer en txt ou csv la liste des cellules latitude et longitude (La,Lo) appartenant a chaque zone ? Merci -- NB : Please note that I do not work on Wednesdays Sigrid LEHUTA ~ ><> ~ Ecologie et Modèles pour l'Halieutique IFREMER Nantes Rue de l'Ile d'Yeu - BP 21105, 44311 Nantes Cedex 03, France Tél : 02 40 37 42 38 (N° interne : 8238) Membre de l'Association Française d'Halieutique https://www.association-francaise-halieutique.fr/

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export 0's in metiers that do not exist in strategies
by Stéphanie Hopkins 25 Nov '21

25 Nov '21

Bonjour à touts: I have just noticed from my resultsExport files, that isis-fish-4.4.6.1 assign a zero value instead of dropping values where strategies do not match metiers. Attached is my database file and an example export. Bon Cordialement, Stéphanie

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Afficher un message dans les logs ISIS
by dedah.ahmed-babou＠ird.fr 23 Nov '21

23 Nov '21

Bonjour, Est-ce qu'il y aurait un un moyen d'écrire un message [System.out.println("Toto: "+var);] dans un éditeur ISIS (editeur de l'équation de recrutement par exemple) qui s'affichera après le lancement de la simulation dans les logs. C'est pour tester si les valeurs prises par une variable sont exactes. Avec mes remerciements. Dedah.

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Deblocage ISIS
by dedah.ahmed-babou＠ird.fr 10 Nov '21

10 Nov '21

Bonjour à toutes et à tous, Quand je clique dans l'éditeur ISIS sur la classe MatrixND ( org.nuiton.math.matrix.MatrixND) le lien ne fonctionne pas. [ http://nuiton.page.nuiton.org/nuiton-matrix/nuiton-matrix/apidocs/org/nuito… | http://nuiton.page.nuiton.org/nuiton-matrix/nuiton-matrix/apidocs/org/nuito… ] Je n'ai pas réussi a avoir la description de cette classe ni dans le site ISIS ni dans le gitlab. Si vous avez une idée de où trouver cette classe et comment ses objets fonctionnent. Avec mes remerciements. Cordialement. Dedah.

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Reproduction/recrutement
by Stephanie MAHEVAS 08 Nov '21

08 Nov '21

Bonjour, Je m'interroge sur l'application du décalage entre la reproduction et le recrutement (nombre de mois entre repro et recrut) et je ne sais pas comment vérifier dans le code ce qu'il se passe (?). Sur le site web, il y a un exemple très clair qui dit que c'est apres la saison de reproduction (ci-dessous). Mais, je trouve que c'est tres contraignant car si le recrutement démarre avant la fin de la reproduction, on ne peut pas le décrire. C'est embetant si il y a de la reproduction et du recrutement toute l'année... Est-ce que le nombre de mois entre la reproduction et le recrutement est compté à partir de la fin de la saison de reproduction (comme c'est décrit dans l'exemple) ou dès le premier mois de la reproduction ? Est-ce qu'on a accès au code? j'ai cherché dans les sources de l'API mais niet... Merci Steph ** *It is called for each time step within the recruitment period (spawning month + recruitment delay + recruitment distribution) : For example, if the spawning period extends from January to March, the delay from spawning to the start of recruitment is 8 months and the recruitment (p) is spread over two months (with a 0.7 of the recruitment the first month and 0.3 the second), then reproductions will hold* * * In September o January (index 0) : ReproductionData (with reproduction data for January, p=0.7) * In October: o January (index 0): ReproductionData (with reproduction data for January, p=0.3) o February (index 1): ReproductionData (with reproduction data for February, p=0.7) * In November o February (index 1): ReproductionData (with reproduction data for February, p=0.3) o March (index 2): ReproductionData (with reproduction data for March, p=0.7) * In December o March (index 2): ReproductionData (with reproduction data for March, p=0.3) * -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) Tel: (33) 2 40 37 41 81 Fax: (33) 2 40 37 40 75 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

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lancement isis avec .sh
by Stephanie MAHEVAS 05 Nov '21

05 Nov '21

Bonjour Eric, que se passe t-il (que l'on ne voit pas) quand on lance isis avec le .sh au lieu du .bat sous windows ? merci Stephanie -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (stephanie.mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) https://annuaire.ifremer.fr/cv/16343/ Tel: (33) 2 40 37 41 81 - 06 75 83 59 33 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

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Help pour définir des zones dans ISIS
by dedah.ahmed-babou＠ird.fr 19 Oct '21

19 Oct '21

Bonjour à toutes et à tous, Est-ce que quelqu'un aurait une solution plus pratique pour définir des zones dans ISIS de manière plus rapide? En fait, je travaille sur une grille assez fine et je passe par mal de temps à faire des clics pour définir une zone sachant que je dois en définir plusieurs dont chacune comporte plusieurs centaines de cellules, en plus la définition des cellules sur terre. Avec mes remerciements. Dedah.

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