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[Isis-fish-user] plan d'anlyse
by chirine HUSSEIN 14 May '09

14 May '09

Bonjour à tous, Je suis en train de tourner les simulations de l’analyse de sensibilité (au totale 256 sim). Cependant, à couse d’un problème de mémoires sur les simulations n’avancent plus. J’ai relancé le plan en indiquant à quelle ligne de la matrice, je dois commencer à faire tourner les simulations. Mais ça ne marche toujours pas, il me met le message « L’élément demandé {0} n’existe pas dans la matrice [256, 9] ». Je vous envoie du fichier d’erreur ? Merci pour l’avance chirine

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[Isis-fish-user] modifier les effectifs initiaux
by chirine HUSSEIN 11 May '09

11 May '09

Bonjour à tous, dans le script de l'analyse de sensibilité, je voudrais modifier les effectifs initiaux , y-a-il une moyenne? j'ai regardé dans l'API, mais je pense qu'il y a rien? merci chirine

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[Isis-fish-user] modifier les effectifs initiaux
by chirine HUSSEIN 11 May '09

11 May '09

Bonjour à tous, dans le script de l'analyse de sensibilité, je voudrais modifier les effectifs initiaux , y-a-il une moyenne? j'ai regardé dans l'API, mais je pense qu'il y a rien? merci chirine

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[Isis-fish-user] analyse de sensibilité
by chirine HUSSEIN 07 May '09

07 May '09

Bonjour à tous, Toujours pour l’analyse de sensibilité , mon plan d’analyse pour 9 paramètres, à priori, j’ai un problème avec un seul (facteur de ciblage) , dans l’interface Editeur de script, le plan d’analyse est correcte, mais les simulations ne tournent pas, et quand j’enlève tous ce qui concerne le facture de ciblage (dans le script), les simulations tournent bien. Je vous envoie le script du plan d’analyse, et le fichier d’erreur. Pourrez-vous jeter un coup d’œil. Merci bien pour l’avance. Chirine

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[Isis-fish-user] Résultats d'une simulation : uniquement abondances / Bug si temps de simu trop long
by Delphine.Rocklin＠ifremer.fr 07 May '09

07 May '09

Bonjour les ISISiens, j'ai fait tourner quelques simus, et 2 soucis, si vous pouvez m'éclairer : 1) une des simus a très bien fonctionné, elle a calculé les abondances de l'espèce sur 5 ans...par contre, quand j'essaye d'afficher l'évolution des captures, là ça ne marche plus, ISI me laisse un graphique tout blanc, sans aucune valeur... 2) j'ai essayé de lancer une simu sur un pas de tps plus long (10 à 30 ans) et ça tourne pour la première année (mais sacrément long) et puis ça bugg...est-ce trop lourd ? Un souci de mémoire ? Merci Delphine

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Re: [Isis-fish-user] Plan d'Analyse ne s'ajoute pas dans l'onget Analys de sensibilité
by Eric Chatellier 28 Apr '09

28 Apr '09

Delphine.Rocklin(a)ifremer.fr a écrit : > Oui, mais NaturalDeathRate est un string et pas un double...je ne peux > donc pas modifier la ligne "string mortalitenaturelle" en "double > mortalitenaturelle" et quel est sa valeur par exemple ? une équation (comme le demandais Sigrid) ? > Le souci c'est que je ne comprends pas ce que signifie i.hasNext() par > exemple. Pour MatrixIterator, il me semble comprendre que cela > correspond à la nouvelle matrice que l'on va créer ds l'analyse de > sensibilité, pour remplacer les valeurs actuelles de la matrice > mortalité naturelle ( MatrixND mn ?). mais je ne sais pas à quoi > correspondent "i.hasNext(), "i.next()" et "i.setValue"... > Pouvez-vous m'éclairer là-dessus ? Un itérateur est un pointeur sur un élément de la matrice. - i.hasNext() renvoie vrai, s'il y a encore un élément après l'élément courant - i.next() déplace le pointeur sur le prochain élément. - i.setValue() change la valeur actuellement pointer Donc pour une matrice de double, i.getValue() est un double aussi. > Merci > delphine PS : pouvez vous répondre sur isis-fish-user(a)lists.labs.libre-entreprise.org on vous répondra mieux que moi, je pense ;) -- Éric <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02 40 50 29 28 http://www.codelutin.com

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[Isis-fish-user] [Fwd: avec le script c'est mieux]
by Sigrid LEHUTA 28 Apr '09

28 Apr '09

-------- Message original -------- Sujet: avec le script c'est mieux Date: Tue, 28 Apr 2009 15:48:56 +0200 De: Delphine.Rocklin(a)ifremer.fr Pour: Sigrid LEHUTA <Sigrid.Lehuta(a)ifremer.fr> Références: <20090424154608.9nxxssik0s44skcw(a)www.ifremer.fr> <49F1C30E.1010508(a)codelutin.com> <49F1C41C.40309(a)codelutin.com> <20090428114147.vdio0m5s048kg4wo(a)www.ifremer.fr> <49F6D4CA.1070409(a)codelutin.com> <49F6FA36.1050700(a)ifremer.fr> Sigrid LEHUTA <Sigrid.Lehuta(a)ifremer.fr> a écrit : > En fait , j ai pas ton script mais dans > > NATURALDEATHRATE > > tu mets (a priori) l'equation de mortalité, non ? donc un string non ? > > Eric Chatellier a écrit : >> Delphine.Rocklin(a)ifremer.fr a écrit : >> >>> Bonjour, >>> >> Bonjour, >> >>> j'ai encore un petit pb avec le script PlanAnalyse....il reste juste >>> un petit souci au niveau de la ligne 300, pour la mortalité naturelle >>> (j'ai réussi à régler le pb de la capturabilité). J'ai vu sur le wiki >>> que la valeur est un "double", mais il semble que le script attende >>> qqch en "string"...je ne sais pas comment tourner le script pour faire >>> ça... >>> >>> Pourriez-vous m'indiquer quelques conseils ? >>> >>> >> La methode attend bien un double. >> >> Mais en argument, vous essayez de multiplié un double et un string >> (mortalitenaturelle) ce qui n'a pas de sens. >> >> Au lieu de : >> String mortalitenaturelle = getString(NATURALDEATHRATE, simNum); >> ne faut-il pas mettre : >> double mortalitenaturelle = getDouble(NATURALDEATHRATE, simNum); >> >>> Ci-joint le script >>> >>> Merci >>> Delphine >>> > > -- > Sigrid LEHUTA > ~ ><> ~ > Doctorante > Département Ecologie et Modèles pour l'Halieutique > IFREMER, rue de l'ile d'Yeu BP 21105 44311 Nantes Cedex 03 > Tél : +33 (0)2 40 37 41 65 > > -- Sigrid LEHUTA ~ ><> ~ Doctorante Département Ecologie et Modèles pour l'Halieutique IFREMER, rue de l'ile d'Yeu BP 21105 44311 Nantes Cedex 03 Tél : +33 (0)2 40 37 41 65

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Re: [Isis-fish-user] Plan d'Analyse ne s'ajoute pas dans l'onget Analys de sensibilité
by Eric Chatellier 28 Apr '09

28 Apr '09

Delphine.Rocklin(a)ifremer.fr a écrit : > Bonjour, Bonjour, > j'ai encore un petit pb avec le script PlanAnalyse....il reste juste > un petit souci au niveau de la ligne 300, pour la mortalité naturelle > (j'ai réussi à régler le pb de la capturabilité). J'ai vu sur le wiki > que la valeur est un "double", mais il semble que le script attende > qqch en "string"...je ne sais pas comment tourner le script pour faire > ça... > > Pourriez-vous m'indiquer quelques conseils ? > La methode attend bien un double. Mais en argument, vous essayez de multiplié un double et un string (mortalitenaturelle) ce qui n'a pas de sens. Au lieu de : String mortalitenaturelle = getString(NATURALDEATHRATE, simNum); ne faut-il pas mettre : double mortalitenaturelle = getDouble(NATURALDEATHRATE, simNum); > Ci-joint le script > > Merci > Delphine -- Éric <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02 40 50 29 28 http://www.codelutin.com

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[Isis-fish-user] Plan d'Analyse ne s'ajoute pas dans l'onget Analys de sensibilité
by Delphine.Rocklin＠ifremer.fr 24 Apr '09

24 Apr '09

Bonjour les ISIS user j'ai un petit souci avec l'analyse de sensibilité. J'essaye de télécharger mon fichier PlanAnalyse depuis la fenêtre du lanceur de simulations, mais ça ne marche pas. J'ai placé mon fichier Plananalyse dans le dossier "AnalysePlan" de isis-database-3 (avec les 2 autres fichiers Calibration et Max qui y sont par défaut). J'arrive à trouver mon fichier dans la liste déroulante, cependant, lorsque je fais "ajouter", il ne se passe rien, il n'apparaît pas dans la fenêtre en-dessous... Qu'est-ce que j'ai mal fait ? Est-ce que ça peut provenir d'une erreur dans le script ? Ou peut-être le fichier n'est pas placé au bon endroit ? Merci Delphine

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Re: [Isis-fish-user] analyse sensibilité, et calibration
by Bastien Preuss 17 Apr '09

17 Apr '09

Sigrid à écrit : Salut Bastien, c'est bien ça tu as tout compris ! (petite précision la calibration c'est de l'optimisation de la valeur du/des paramètres par rapport à un objectif, c'est différent de l'incertitude, même si on calibre en général en effet des paramètres mal connus) autre chose on peut faire de l optimisation avec des simu indépendantes et de l analyse de sensibilité avec des simu dépendantes: "tout est possible !" (Thuram, 1998) sur le wiki ce sont juste des exemples. Delphine et toi créerez bientot vos propres scripts de calibration et sensibilité que vous posterez sur le wiki ! Autre info interessante : dans la nouvelle version qui marche pas encore top, il y aura une interface analyse de sensibilité pour lancer des analyses simples sans coder... Pour Java faudra y passer mais ca sera plus facile à comprendre quand tu auras lu l'algo du simplex en francais(anglais?) dans le bouquin de Walters et ya le site de sun avec de tres bons tutoriaux http://java.sun.com/docs/books/tutorial/ et ya aussi plein de forums sur internet (c est comme ca que j ai appris petit a petit)

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