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AS - pas de resultats dans isis.simule du Rdata
by Stephanie.Mahevas＠ifremer.fr 23 Jun '15

23 Jun '15

Bonsoir, je suis bien embetee car dans l'objet isis.simule de mon Rdata, il n'y a pas les valeurs des outputs selectiones (ils sont pourtant bien dans le repertoire sensitivityResults de chaque simu de l'as et quand je demande l'analyse dans l'interface elle se fait comme il faut). Toutes les simu ont tournees sans probleme. quelqu'un a t-il une idee? j'ai attache la simu sans les results et sans les exports + le Rdata genere. Merci Steph

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Fonction Isis pour zones
by Francois TIMON 19 Jun '15

19 Jun '15

Bonjour, Je suis à la recherche de la fonction dans ISIS qui permet de récupérer toutes les zones définies dans une région. On m'a parlé de la classe SiMatrix mais je ne retrouve pas les détails de cette classe sur les API : ISIS, NuitonMatrix et même Java. Quelle fonction dois-je utiliser ? Ou sinon où puis-je trouver les détails de la classe SiMatrix ? Merci d'avance. Cordialement

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Ne pas conserver les "results"
by Sigrid Lehuta 11 Jun '15

11 Jun '15

Hello, Il me semble qu'en V3.4 on peut choisir de ne pas conserver les résultats d'une simulation (ne pas conserver le dossier "results" mais conserver "resultExport" uniquement) Comment faut-il procéder ? (je suis en train d'essayer de les supprimer de mes simus en V3.3, car c'est si lourd que mon disque dur est plein ! ça prend plusieurs dizaines de minutes par simulation pour supprimer ! cette option sera donc bien utile) Merci

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isis 4.3.1.1 ne s ouvre pas :-(
by Sigrid Lehuta 03 Jun '15

03 Jun '15

hello j ai un soucis isis ne s 'ouvre plus voila le debug a savoir mon disque dur est archi plein, j essai de regler ca aussi mais peut etre est ce la cause...

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log.info, log.error
by Stephanie MAHEVAS 01 Jun '15

01 Jun '15

Eric, comment faire pour que les log.info fonctionnent et apparaissent dans le debug? Il faut que je mette mes ecritures de verification en log.error pour les voir... Merci Stephanie -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) Tel: (33) 2 40 37 41 81 Fax: (33) 2 40 37 40 75 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

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Problème avec règle de gestion
by Francois TIMON 01 Jun '15

01 Jun '15

Bonjour, J'ai une règle de gestion simple, uniquement sensée ajuster des valeurs d'abondances par soustraction d'une valeur de capture que je récupère dans un fichier .csv Or, lors de mes simulations, la matrice d'abondance que je récupère en export est exactement la même que j'applique ma règle ou non. Cela insinue donc que ma règle ne fonctionne pas. Malgré une bonne compilation du script. En effet, lorsque j'observe les "log" de la simulations j'obtiens le Warning : "WARN|11:21:35,581|SimulationParameterImpl.java|638|getRules|Can't find rule: AjustAbondanceWithCapture" et ceux pour chaque espèces inclue dans la simulations et devant subir cette règle. Isis ne semble pas trouver "AjustAbondanceWithCapture" qui est le nom de ma règle, alors que cette dernière est bien présente dans l'interface de simulation, ainsi que dans le "VCS Communauté" Je requière donc votre aide car je ne trouve pas de solution à mon problème. En fichier ci-joint, compressé sous archive, le fichier Java de la règle, les simulations effectuées avec et sans la règle ainsi que les fichier .csv qui doivent être importés pour corrigé les abondances. Merci d'avance pour votre aide. Cordialement François TIMON

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creation d'un nouveau scripts = fonction objectif à minimiser
by Stephanie MAHEVAS 28 May '15

28 May '15

bonjour est-ce correct de creer un script pour minimiser une fonction qui ressemble à ObjectiveFunctionBaranov comme attaché? il est utiliser dans la regle HCR jointe. Les deux codes sont dans isis-community. merci Stephanie -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) Tel: (33) 2 40 37 41 81 Fax: (33) 2 40 37 40 75 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

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interactions negatives entre regles...
by Stephanie.Mahevas＠ifremer.fr 27 May '15

27 May '15

j'ai une regle qui fonctionne sans probleme lorsque je l'utilise dans une simulation avec peu de regles. Elle plante avec un message pas sympa lorsqu'elle tourne avec plein d'autres regles. Une idee Eric? merci Stephanie

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SiMatrix.fishingMortalityPerGroup
by Stephanie.Mahevas＠ifremer.fr 26 May '15

26 May '15

toujours avec la meme base, je fais uniquement tourner les regles pour le merlu et ca plante en decembre 0 (donc ca ne vient pas de la regle HCR qui demarre en janvier 6). J'ai corrige une erreur dans CapturesLongLiners....java (j'avais oublie la dimension step dans une matrice de resultname). et voici mon message d'erreur. Je mets le zip (hake.zip) de la simu qui s'appelle sim_test_MAP_Hake_Peche_GravCaptTACTailleMin_9ans_2015-05-25-17-02 (nom trop long pour le zip) sur le ftp ifremer ( ftp://ftp.ifremer.fr/ifremer/divers/hake.zip) Qqn a t-il une idee? Merci Steph ERROR|16:51:35,545|InProcessSimulatorLauncher.java|484|localSimulateSameThread|Error during simulation java.lang.ArrayIndexOutOfBoundsException: 1 at org.nuiton.math.matrix.AbstractMatrixND.getDim(AbstractMatrixND.java:329) at org.nuiton.math.matrix.AbstractMatrixND.sumOverDim(AbstractMatrixND.java:611) at org.nuiton.math.matrix.MatrixSemanticsDecorator.sumOverDim(MatrixSemanticsDecorator.java:382) at scripts.SiMatrix.fishingMortalityPerGroup_aroundBody98(SiMatrix.java:1946) at scripts.SiMatrix$AjcClosure99.run(SiMatrix.java:1) at org.aspectj.runtime.reflect.JoinPointImpl.proceed(JoinPointImpl.java:149) at fr.ifremer.isisfish.util.IsisCache.realCall(IsisCache.java:202) at fr.ifremer.isisfish.util.IsisCache.get(IsisCache.java:143) at fr.ifremer.isisfish.aspect.CacheAspect.call(CacheAspect.java:73) at scripts.SiMatrix.fishingMortalityPerGroup(SiMatrix.java:1895) at simulators.DefaultSimulator.computeMonth(DefaultSimulator.java:513) at simulators.DefaultSimulator.simulate(DefaultSimulator.java:216) at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.InProcessSimulatorLauncher.localSimulateSameThread(InProcessSimulatorLauncher.java:441) at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.InProcessSimulatorLauncher$SimThread.run(InProcessSimulatorLauncher.java:271)

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Pb dans regle HCR
by Stephanie MAHEVAS 26 May '15

26 May '15

plus de pb de groupe, pb de somme sur les elements d'une matrice ERROR|10:37:29,102|InProcessSimulatorLauncher.java|484|localSimulateSameThread|Error during simulation java.lang.NullPointerException at rules.HCR_Nephrops_DLStrend.preAction_aroundBody2(HCR_Nephrops_DLStrend.java:227) at rules.HCR_Nephrops_DLStrend$AjcClosure3.run(HCR_Nephrops_DLStrend.java:1) at org.aspectj.runtime.reflect.JoinPointImpl.proceed(JoinPointImpl.java:149) at fr.ifremer.isisfish.aspect.RuleAspect.makeTimedCall(RuleAspect.java:121) at fr.ifremer.isisfish.aspect.RuleAspect.initPreCall(RuleAspect.java:85) at rules.HCR_Nephrops_DLStrend.preAction(HCR_Nephrops_DLStrend.java:159) at simulators.DefaultSimulator.simulate(DefaultSimulator.java:198) at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.InProcessSimulatorLauncher.localSimulateSameThread(InProcessSimulatorLauncher.java:441) at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.InProcessSimulatorLauncher$SimThread.run(InProcessSimulatorLauncher.java:271) -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) Tel: (33) 2 40 37 41 81 Fax: (33) 2 40 37 40 75 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

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