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null child not allowed
by Sigrid Lehuta 21 Nov '16

21 Nov '16

j'ai cette erreur au demarrage de isis 4.4.0.2 snapshot qu est ce que ca signifie ?. merci java.lang.NullPointerException: Null child not allowed at javax.swing.tree.TreePath.pathByAddingChild(TreePath.java:327) at javax.swing.tree.VariableHeightLayoutCache$TreeStateNode.setParent(VariableHeightLayoutCache.java:1066) at javax.swing.tree.DefaultMutableTreeNode.insert(DefaultMutableTreeNode.java:187) at javax.swing.tree.DefaultMutableTreeNode.add(DefaultMutableTreeNode.java:411) at javax.swing.tree.VariableHeightLayoutCache$TreeStateNode.expand(VariableHeightLayoutCache.java:1486) at javax.swing.tree.VariableHeightLayoutCache$TreeStateNode.expand(VariableHeightLayoutCache.java:1288) at javax.swing.tree.VariableHeightLayoutCache.rebuild(VariableHeightLayoutCache.java:743) at javax.swing.tree.VariableHeightLayoutCache.setModel(VariableHeightLayoutCache.java:109) at javax.swing.plaf.basic.BasicTreeUI.setModel(BasicTreeUI.java:412) at javax.swing.plaf.basic.BasicTreeUI$Handler.propertyChange(BasicTreeUI.java:3414) at java.beans.PropertyChangeSupport.fire(PropertyChangeSupport.java:335) at java.beans.PropertyChangeSupport.firePropertyChange(PropertyChangeSupport.java:327) at java.beans.PropertyChangeSupport.firePropertyChange(PropertyChangeSupport.java:263) at java.awt.Component.firePropertyChange(Component.java:8430) at javax.swing.JTree.setModel(JTree.java:882) at fr.ifremer.isisfish.ui.script.ScriptUI.$completeSetup(ScriptUI.java:1362) at fr.ifremer.isisfish.ui.script.ScriptUI.$initialize(ScriptUI.java:1480) at fr.ifremer.isisfish.ui.script.ScriptUI. (ScriptUI.java:195) at fr.ifremer.isisfish.ui.WelcomeTabUI.$initialize(WelcomeTabUI.java:415) at fr.ifremer.isisfish.ui.WelcomeTabUI. (WelcomeTabUI.java:123) at fr.ifremer.isisfish.ui.WelcomeHandler.afterInit(WelcomeHandler.java:99) at fr.ifremer.isisfish.ui.WelcomeUI.$afterCompleteSetup(WelcomeUI.java:96) at fr.ifremer.isisfish.ui.WelcomeUI.$completeSetup(WelcomeUI.java:583) at fr.ifremer.isisfish.ui.WelcomeUI.$initialize(WelcomeUI.java:754) at fr.ifremer.isisfish.ui.WelcomeUI. (WelcomeUI.java:109) at fr.ifremer.isisfish.IsisFish$3.run(IsisFish.java:719) at java.awt.event.InvocationEvent.dispatch(InvocationEvent.java:311) at java.awt.EventQueue.dispatchEventImpl(EventQueue.java:756) at java.awt.EventQueue.access$500(EventQueue.java:97) at java.awt.EventQueue$3.run(EventQueue.java:709) at java.awt.EventQueue$3.run(EventQueue.java:703) at java.security.AccessController.doPrivileged(Native Method) at java.security.ProtectionDomain$JavaSecurityAccessImpl.doIntersectionPrivilege(ProtectionDomain.java:76) at java.awt.EventQueue.dispatchEvent(EventQueue.java:726) at java.awt.EventDispatchThread.pumpOneEventForFilters(EventDispatchThread.java:201) at java.awt.EventDispatchThread.pumpEventsForFilter(EventDispatchThread.java:116) at java.awt.EventDispatchThread.pumpEventsForHierarchy(EventDispatchThread.java:105) at java.awt.EventDispatchThread.pumpEvents(EventDispatchThread.java:101) at java.awt.EventDispatchThread.pumpEvents(EventDispatchThread.java:93) at java.awt.EventDispatchThread.run(EventDispatchThread.java:82)

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Config R dans ISIS
by Audric Vigier 21 Nov '16

21 Nov '16

Bonsoir, Je suis entrain de configurer ISIS 4.4.0.2 pour pouvoir appeler R dans ISIS. -Est-ce que ça sert à quelque chose que j'utilise Rserve? -Je suis la doc du site : j'ai un Java 1.8 64 bit et un R 3.2.2 64 bit. J'ai installé rJava, j'ai redéfini la variable d'environnement correctement (je suis malheureusement contraint de travailler sous Windows). Pourtant quand je teste la configuration R dans ISIS, ce n'est pas bon (le dernier champ est rouge avec le même message d'erreur que dans la doc du site ("Le path ne contient pas le dossier bin de R" ....alors qu'en fait si, ce répertoire existe bien)). Qu'est-ce que je dois faire d'autre pour que ça fonctionne? -Par ailleurs, quand j'utilise une première fois le bouton "tester" dans configuration de R, ISIS m'indique qu'il me manque deux librairies d'AS, alors que je les ai installées (sous R 3.2.2 64 bit). Il n'y a pas moyen d'enlever ces 2 warnings? Suite à ça, il y a bien un test. Par contre si je demande une deuxième fois, ISIS plante. Bon week-end Audric -- Audric Vigier Doctorant à Ifremer, unités EMH (Nantes) et STH/LBH (Brest) E-mail : audric.vigier(a)ifremer.fr Tel : +33 (0)2 40 37 41 64 (8164)

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ajout d'une base sur le site
by smahevas 21 Nov '16

21 Nov '16

Bonjour je voulais rajouter la base Golfe de Gascogne (dans la partie telechargement) qui a servi à faire les simus pour la prospective (les dents du Golfe) et je n'y arrive pas. Quand je veux sauver et que je tape mon user et mot de passe il me dit impossible de faire la modification. Peut-etre un mauvais mot de passe mais je ne vois pas comment le redemander. Comment je peux faire??? merci Stephanie

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[RESOLU] pb au téléchargement de ISIS 4.4.0.2
by Audric Vigier 20 Nov '16

20 Nov '16

Bonjour, J'ai téléchargé hier ISIS 4.4.0.2 via le site ISIS-Fish, j'ai eu plusieurs soucis : -ISIS-Fish refusait de se lancer via le .bat. En allouant moins de mémoire (900M), ISIS-Fish accepte de se lancer. java -Xmx900M -jar isis-fish-4.4.0.2.jar %1 %2 %3 %4 %5 %6 %7 %8 %9 > debug.txt 2>&1 - J'ai installé ISIS 4.4.0.2 (avec un .bat modifié comme à la réunion des utilisateurs de janvier 2016) alors qu'un ISIS 4.3 étant présent. Il a eu des soucis pour télécharger certains fichiers de isis-database. Mon isis-database/resulinfos était vide, donc forcément, pas moyen d'exporter de résultats en testant sur une simu bidon. Il a fallu forcer le téléchargement de isis-database en supprimant le répertoire isis-fish-4 et en relançant ISIS-Fish. Ca ne marche qu'avec le .bat modifié comme ci-dessus. Sinon, je n'ai pas accès au serveur. Solution : modifier le .bat.... et le proposer ainsi au téléchargement. Mon problème est résolu depuis. Bonne journée, Audric -- Audric Vigier Doctorant à Ifremer, unités EMH (Nantes) et STH/LBH (Brest) E-mail : audric.vigier(a)ifremer.fr Tel : +33 (0)2 40 37 41 64 (8164)

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Ressources Isis-fish
by Postmaster ISIS-Fish 30 Sep '16

30 Sep '16

Amis utilisateurs d'ISIS-Fish, Ce mail automatique, envoyé tous les 3 mois sur les listes de diffusions du projet, a pour but de vous rappeler toutes les ressources disponibles pour toutes vos éventuelles questions et problèmes. Documentation et manuel utilisateurs ------------------------------------ La documentation d'ISIS-Fish est présente sur le site à cette adresse : http://isis-fish.org/v4/index.html. N'hésitez pas à nous remonter les parties qui ne sont pas claires ou les parties qui ne sont pas à jour, le logiciel évoluant, certaines parties de la documentation sont peut-être obsolètes. Questions et FAQ ---------------- Vous pouvez poser vos questions à cette même liste de diffusion en envoyant un mail à isis-fish-users(a)list.isis-fish.org. Toutes les personnes abonnées le recevront et pourront répondre à vos éventuelles questions. N'oubliez pas, avant de poser votre question, de rechercher parmis les archives de la liste (http://list.isis-fish.org/pipermail/isis-fish-users/) votre question a peut-être déjà été posée. Les questions les plus fréquemment posées sont regroupées sur le site sur la page FAQ : http://isis-fish.org/v4/user/FAQ.html Forge, rapports de bug, suivi des évolutions -------------------------------------------- Si vous rencontrez un bug, vous pouvez vérifier sur la forge ISIS-Fish (http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/issues) si nous en avons déjà connaissance. Si nous n'en avons pas connaissance, vous pouvez nous rapporter le bug, nous l'intègrerons dans la liste des évolutions prévues (http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/roadmap) Pour rapporter un bug (ou une demande d'évolution), donnez nous le maximum de détails sur ce bug (comment vous l'avez obtenu ? votre base, vos paramètres et le fichier debug.txt). Plus nous avons d'informations, plus nous pourrons vous aider simplement. L'équipe ISIS-Fish

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error : removeMonitoredSimulations
by Sigrid Lehuta 29 Sep '16

29 Sep '16

J ai cette errreur aussi au demarrage et isis ne se lmance pas... :-( ou est le pb ? merci java.lang.NullPointerException at fr.ifremer.isisfish.cron.RemoveOldFileTask.removeMonitoredSimulations(RemoveOldFileTask.java:79) at fr.ifremer.isisfish.cron.RemoveOldFileTask.run(RemoveOldFileTask.java:63) at java.lang.Thread.run(Thread.java:745)

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Rencontre annuelle des utilisateurs-développeurs ISIS
by Stephanie MAHEVAS 27 Sep '16

27 Sep '16

Chèrs//ISIS-Fishiens nous vous proposons de nous retrouver le 5 décembre 2016 pour faire un point sur le simulateur salle de de Visio 2 à Nantes. A l'ordre du jour: * dernière version * nouveaux développements * applications : Manche, Golfe de Gascogne, Golfe du Lion * projets à venir * budget * fonctionnement général * questions diverses Je bloque la salle de Visio 2 sur Nantes pour la réunion pour que les gens à distance ne soient pas obligés de se déplacer. Merci de nous dire si vous comptez venir (mission à prendre sur A060720F03) ou de reserver une salle visio sur votre site. Au plaisir de tous se retrouver, Sigrid et Stéphanie -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) Tel: (33) 2 40 37 41 81 Fax: (33) 2 40 37 40 75 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

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AS - je n'arrive pas à relancer une AS qui marchait hier....
by smahevas 16 Sep '16

16 Sep '16

fr.ifremer.isisfish.IsisFishRuntimeException: Can't get scenarios from calculator at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationService.submit(SimulationService.java:532) at fr.ifremer.isisfish.ui.simulator.SimulAction.launchSimulation(SimulAction.java:1087) at fr.ifremer.isisfish.ui.simulator.SimulAction.launchSimulationWithSensibility(SimulAction.java:1100) at fr.ifremer.isisfish.ui.simulator.ParamsUI.launchSimulation(ParamsUI.java:369) at fr.ifremer.isisfish.ui.simulator.ParamsUI.doActionPerformed__on__buttonSimulParamsSimulate(ParamsUI.java:619) at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke0(Native Method) at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke(Unknown Source) at sun.reflect.DelegatingMethodAccessorImpl.invoke(Unknown Source) at java.lang.reflect.Method.invoke(Unknown Source) at jaxx.runtime.JAXXUtil$1.invoke(JAXXUtil.java:257) at com.sun.proxy.$Proxy3.actionPerformed(Unknown Source) at javax.swing.AbstractButton.fireActionPerformed(Unknown Source) at javax.swing.AbstractButton$Handler.actionPerformed(Unknown Source) at javax.swing.DefaultButtonModel.fireActionPerformed(Unknown Source) at javax.swing.DefaultButtonModel.setPressed(Unknown Source) at javax.swing.plaf.basic.BasicButtonListener.mouseReleased(Unknown Source) at java.awt.Component.processMouseEvent(Unknown Source) at javax.swing.JComponent.processMouseEvent(Unknown Source) at java.awt.Component.processEvent(Unknown Source) at java.awt.Container.processEvent(Unknown Source) at java.awt.Component.dispatchEventImpl(Unknown Source) at java.awt.Container.dispatchEventImpl(Unknown Source) at java.awt.Component.dispatchEvent(Unknown Source) at java.awt.LightweightDispatcher.retargetMouseEvent(Unknown Source) at java.awt.LightweightDispatcher.processMouseEvent(Unknown Source) at java.awt.LightweightDispatcher.dispatchEvent(Unknown Source) at java.awt.Container.dispatchEventImpl(Unknown Source) at java.awt.Window.dispatchEventImpl(Unknown Source) at java.awt.Component.dispatchEvent(Unknown Source) at java.awt.EventQueue.dispatchEventImpl(Unknown Source) at java.awt.EventQueue.access$500(Unknown Source) at java.awt.EventQueue$3.run(Unknown Source) at java.awt.EventQueue$3.run(Unknown Source) at java.security.AccessController.doPrivileged(Native Method) at java.security.ProtectionDomain$JavaSecurityAccessImpl.doIntersectionPrivilege(Unknown Source) at java.security.ProtectionDomain$JavaSecurityAccessImpl.doIntersectionPrivilege(Unknown Source) at java.awt.EventQueue$4.run(Unknown Source) at java.awt.EventQueue$4.run(Unknown Source) at java.security.AccessController.doPrivileged(Native Method) at java.security.ProtectionDomain$JavaSecurityAccessImpl.doIntersectionPrivilege(Unknown Source) at java.awt.EventQueue.dispatchEvent(Unknown Source) at java.awt.EventDispatchThread.pumpOneEventForFilters(Unknown Source) at java.awt.EventDispatchThread.pumpEventsForFilter(Unknown Source) at java.awt.EventDispatchThread.pumpEventsForHierarchy(Unknown Source) at java.awt.EventDispatchThread.pumpEvents(Unknown Source) at java.awt.EventDispatchThread.pumpEvents(Unknown Source) at java.awt.EventDispatchThread.run(Unknown Source) Caused by: java.lang.NullPointerException at fr.ifremer.isisfish.mexico.MexicoHelper.getStringFromObject(MexicoHelper.java:560) at fr.ifremer.isisfish.mexico.xml.DiscreteDomainXMLVisitor.visit(DiscreteDomainXMLVisitor.java:76) at fr.ifremer.isisfish.simulator.sensitivity.domain.DiscreteDomain.accept(DiscreteDomain.java:125) at fr.ifremer.isisfish.mexico.xml.FactorXMLVisitor.visit(FactorXMLVisitor.java:118) at fr.ifremer.isisfish.simulator.sensitivity.Factor.accept(Factor.java:287) at fr.ifremer.isisfish.mexico.xml.FactorGroupXMLVisitor.visit(FactorGroupXMLVisitor.java:62) at fr.ifremer.isisfish.simulator.sensitivity.FactorGroup.accept(FactorGroup.java:279) at fr.ifremer.isisfish.mexico.xml.DesignPlanXMLVisitor.visit(DesignPlanXMLVisitor.java:88) at fr.ifremer.isisfish.simulator.sensitivity.DesignPlan.accept(DesignPlan.java:103) at fr.ifremer.isisfish.mexico.MexicoHelper.getDesignPlanAsXML(MexicoHelper.java:104) at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationService.submit(SimulationService.java:453) ... 46 more

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erreur dans la regle CantonnementPreSimu
by smahevas 16 Sep '16

16 Sep '16

Bonjour je viens de relancer une vieille simu en changeant le parametrage de le regle PreSimu. Dans la vielle simu cette regle s'appliquait tous les mois de l'annee et là j'ai tester de janvier à Juin. Et ca plante... merci Steph voici le log INFO|18:27:17,684|CantonnementPreSimu.java|159|init_aroundBody0|l engin du mÃÂ©tier est bien concernÃÂ© INFO|18:27:17,688|CantonnementPreSimu.java|154|init_aroundBody0|metier examinÃÂ© metier benth jum INFO|18:27:17,688|CantonnementPreSimu.java|159|init_aroundBody0|l engin du mÃÂ©tier est bien concernÃÂ© INFO|18:27:17,695|CantonnementPreSimu.java|172|init_aroundBody0|il y a bien intersection entre la zone mÃÂ©tier et le cantonnement pour la saison [janvier, février, mars, avril, mai, juin, juillet, août, septembre, octobre, novembre, décembre] INFO|18:27:17,704|CantonnementPreSimu.java|245|init_aroundBody0|il y a intersection de la saison de fermeture avec la saison mÃÂ©tier de janvier ÃÂ décembre INFO|18:27:17,705|CantonnementPreSimu.java|265|init_aroundBody0|de janvier ÃÂ juin le metier peche en MetaCantonnement-metier benth jum -[janvier, février, mars, avril, mai, juin, juillet, août, septembre, octobre, novembre, décembre] INFO|18:27:17,705|CantonnementPreSimu.java|266|init_aroundBody0|de juillet ÃÂ décembre le metier peche en [zone metier benth] ERROR|18:27:17,706|InProcessSimulatorLauncher.java|484|localSimulateSameThread|Error during simulation java.util.ConcurrentModificationException at java.util.ArrayList$Itr.checkForComodification(Unknown Source) at java.util.ArrayList$Itr.next(Unknown Source) at org.hibernate.collection.internal.AbstractPersistentCollection$IteratorProxy.next(AbstractPersistentCollection.java:789) at rules.CantonnementPreSimu.init_aroundBody0(CantonnementPreSimu.java:161) at rules.CantonnementPreSimu$AjcClosure1.run(CantonnementPreSimu.java:1) at org.aspectj.runtime.reflect.JoinPointImpl.proceed(JoinPointImpl.java:149) at fr.ifremer.isisfish.aspect.RuleAspect.makeTimedCall(RuleAspect.java:121) at fr.ifremer.isisfish.aspect.RuleAspect.initCall(RuleAspect.java:70) at rules.CantonnementPreSimu.init(CantonnementPreSimu.java:140) at simulators.DefaultSimulator.simulate(DefaultSimulator.java:111) at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.InProcessSimulatorLauncher.localSimulateSameThread(InProcessSimulatorLauncher.java:441) at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.InProcessSimulatorLauncher$SimThread.run(InProcessSimulatorLauncher.java:271) INFO|18:27:17,734|InProcessSimulatorLauncher.java|513|localSimulateSameThread|Simulation time: 4.660 INFO|18:27:17,737|IsisCacheBackendOnGuava.java|239|adjustedCache|Cache size ajusted to 3,316Ko (equivalent to 2 step need) INFO|18:27:17,750|InProcessSimulatorLauncher.java|202|message|Simulation terminée INFO|18:27:17,750|SimulationControl.java|206|setText|Simulation terminée

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acceder aux parametres de simu ds l init d un optim plan
by Sigrid Lehuta 01 Sep '16

01 Sep '16

Hello, je veuix recuperer le nombre d annees de simu et les pops dans l'init d'un optimization plan. J'ai acces a optimization Context mais toutes les methodes qui donne acces a un simulation storage cree une nouvelle simu, ce que je ne souhaite pas faire en init. comment faire ? Merci

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