- Isis-fish-users - mailman.cloud.codelutin.com

Fwd: [marbec-tous] Soutenance de thèse Dedah AHMED BABOU, MARDI 13 JUIN 2023 / 14H00 À MONTPELLIER
by Stephanie MAHEVAS May 26, 2023

May 26, 2023

Bonjour à tous Dedah soutient sa thèse e 13 juin prochain ! Pour celles et ceux qui sont interessées, je ferai suivre le lien zoom dès que je l'aurais. Bon we Stephanie -------- Message transféré -------- Sujet : [marbec-tous] Soutenance de thèse Dedah AHMED BABOU, MARDI 13 JUIN 2023 / 14H00 À MONTPELLIER Date : Fri, 26 May 2023 16:15:06 +0200 De : Isabelle VIDAL AYOUBA, Sete IRD, 04 99 57 32 56 <isabelle.vidal-ayouba(a)ird.fr> Répondre à : Isabelle VIDAL AYOUBA, Sete IRD, 04 99 57 32 56 <isabelle.vidal-ayouba(a)ird.fr> Pour : marbec-tous(a)listes.ird.fr Bonjour, *Dedah AHMED BABOU*soutiendra sa thèse MARDI 13 JUIN 2023 à 14H00 en*salle SC36.09**à la Faculté des Sciences de Montpellier* 30, Place E. Bataillon, 34095 Montpellier (informations en pièce jointe). Le lien Zoom vous sera communiqué ultérieurement. Bon week-end, Isabelle. -- -- Isabelle Vidal Ayouba <mailto:isabelle.vidal-ayouba@ird.fr> Communication et publications Site web MARBEC <https://www.umr-marbec.fr> Collection MARBEC dans HAL <https://hal.umontpellier.fr/MARBEC/> UMR MARBEC 248 / 9190 Avenue Jean Monnet CS 30171 34203 Sète cedex tel +33 (0)499 573 256 /En congés le mercredi après-midi/ Logo MARBEC <http://www.umr-marbec.fr>

1 0

Problème mdp Datrmor
by Antoine RICOUARD May 26, 2023

May 26, 2023

Bonjour Eric, J'ai tenté l'autre jour de lancer une simulation sur Datarmor, en passant par l'interface ISIS. Lorsqu'il m'a demandé le mot-de-passe, j'ai rentré mon mot-de-passe habituel dans la boîte de dialogue, ça n'a pas marché (je précise que je n'avais fait aucun réglage préalable avant de lancer la simulation sinon de choisir Datarmor au moment du lancement). Non seulement, il n'a pas accepté mon mot-de-passe, mais maintenant, à chaque fois que je démarre ISIS, ordinateur connecté à internet, il ouvre une fenêtre me demandant le mot-de-passe. Si je ferme la fenêtre, elle revient au bout de quelques secondes si bien que je ne peut plus utiliser ISIS sauf à travailler hors ligne. Comment résoudrte ce problème ? Merci. -- Antoine RICOUARD\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\|/////// PhD student~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~/|\~~~ — @ — ~~~~ FREMER - PDG-RBE-MARBEC-LHM~~~~~~~~~~~~~~/_|_\~~~~/|\~~~~~ Station de Sète - Avenue Jean Monnet~~~~~\___/~~ ~~ ~~ CS 30171 - 34203 Sète Cedex~~~~ ~~~~ ~~~~ ~~~~ ~~~~ Tel.: 06.48.71.03.95 ~~~~~~~~ ~~~~~~ ~~~~~~~~~ Email: antoine.ricouard(a)ifremer.fr ~~~~~~~

2 1

java heap space
by Stephanie MAHEVAS May 23, 2023

May 23, 2023

Bonjour ci-joint le debug d'une simu qui a planté à cause d'un pb de memoire... cela me fait penser au pb pour la pecherie merlu du GdG je mets aussi la pecherie merci de ton aide Bonne soirée Stephanie -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS UMR MARBEC - site de Sète IFREMER/HM https://annuaire.ifremer.fr/cv/16343/ Tel: (33) 04 99 57 32 39 (8239) - 06 75 83 59 33 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

2 5

Problèmes dans les simulations
by aricouar May 9, 2023

May 9, 2023

Bonjour Eric, Nous rencontrons des difficultés à faire tourner la base nouvellement paramétrée d'ISIS (base ci-jointe). Lorsque nous lançons la base avec toutes les espèces SAUF Raja_clavata et Leucoraja_naevus (ces espèces-là ont d'autres problèmes), la simulation tourne à première vue normalement mais arrivée au mois décembre 1, la simulation ne progresse plus. On reste à décembre 1 pendant très très longtemps, pourtant ISIS ne renvoie pas d'erreur. Si on regarde le debug (ci-joint), on observe depuis le début de la simulation ce message : 023-05-05 17:36:45,358 INFO [Thread-18] (SubProcessSimulationLauncher.java:284) run - dans un sous processus>2023-05-05 17:36:45,358 WARN [SimThread sim_Ref_MACCO_BoB_NoRaysAllStr_2015to2018_2023-05-05-16-40] (PopulationSeasonInfoImpl.java:516) getMigrationMatrix - Erreur dans la migration, un coef est negatif Nous ne comprenons pas pourquoi des coefficients sont négatifs ni si cela est lié au fait que la simulation ne progresse plus à partir de décembre 1. Un idée ? -- Antoine RICOUARD\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\|/////// PhD student~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~/|\~~~ — @ — ~~~~ FREMER - PDG-RBE-MARBEC-LHM~~~~~~~~~~~~~~/_|_\~~~~/|\~~~~~ Station de Sète - Avenue Jean Monnet~~~~~\___/~~ ~~ ~~ CS 30171 - 34203 Sète Cedex~~~~ ~~~~ ~~~~ ~~~~ ~~~~ Tel.: 06.48.71.03.95 ~~~~~~~~ ~~~~~~ ~~~~~~~~~ Email: antoine.ricouard(a)ifremer.fr ~~~~~~~

2 1

Re: [Isis-fish-users] *******SPAM******* Re: Import Target Factors
by aricouar May 4, 2023

May 4, 2023

Je ne sais pas s'il a tourné pour tous les métiers mais pour un assez grand nombre et il s'est arrêté au métier qui pose problème : 2023-04-24 14:15:56,045 WARN [AWT-EventQueue-0] (FillTargetFactor_Eric.java:72) setTargetFactor - > metier: O_metier_OTH_Zunique @ Flottilles agrégées-0-10 2023-04-24 14:15:56,045 WARN [AWT-EventQueue-0] (FillTargetFactor_Eric.java:76) setTargetFactor - > species: Nephrops_norvegicus Le 2023-04-24 17:08, Stephanie MAHEVAS a écrit : > il rale mais il a tourné pour tous les metiers ? > > Le 24/04/2023 à 16:48, aricouar a écrit : > > i-joint le debug. Il y a ces erreurs qui apparaissent à la toute fin : > > 2023-04-24 16:39:22,418 ERROR [Finalizer] (TopiaContextImpl.java:880) finalize - TopiaContext org.nuiton.topia.framework.TopiaContextImpl@2ed8abb2 was not closed! > 2023-04-24 16:44:02,664 ERROR [Finalizer] (TopiaContextImpl.java:880) finalize - TopiaContext org.nuiton.topia.framework.TopiaContextImpl@2b9c410d was not closed! > 2023-04-24 16:44:02,709 ERROR [Finalizer] (TopiaContextImpl.java:880) finalize - TopiaContext org.nuiton.topia.framework.TopiaContextImpl@5b753572 was not closed! > > Le 2023-04-24 15:47, Eric Chatellier a écrit : > Ok, dans mon cas, j'ai : > > Caused by: java.util.NoSuchElementException: L'objet passé en argument n'a pas été retrouvé ou la dimension donnée ne convient pas:L_1_Zunique @ Fileyeurs exclusifs-10-12 in ... > > Et effectivement, le metier 'L_1_Zunique @ Fileyeurs exclusifs-10-12' n'existe pas dans myTFfile.txt > > As d'autres erreur dans le fichier debug.txt lorsque tu execute le script ? > > Le 24/04/2023 à 15:33, aricouar a écrit : > J'ai repris le tiens directement, que j'ai simplement renommé; Je le joins tout-de-même à ce message. _______________________________________________ Isis-fish-users mailing list Isis-fish-users(a)list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users Archives et moteur de recherche: http://list.isis-fish.org/pipermail/isis-fish-users/ -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS UMR MARBEC - site de Sète IFREMER/HM https://annuaire.ifremer.fr/cv/16343/ Tel: (33) 04 99 57 32 39 (8239) - 06 75 83 59 33 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

3 4

Re: [Isis-fish-users] question java
by Stephanie MAHEVAS May 3, 2023

May 3, 2023

hello Eric je te mets la rule actuelle avec l'algo (dans la partie initialisation de la regle) en explicitant ce que je ne sais pas coder. Merci d'avance de ton aide. on peut s'appeler demain matin. Bonne soirée Stephanie Le 03/05/2023 à 17:48, Stephanie MAHEVAS a écrit : > > Bonjour > > je veux remplir dans l'init d'une règle > > 1 matrice matNbVess de dimension annee, set of vessels avec un > fichier pour chaque annee (0 à 4) qui contient un vecteur au format > semantics des set of vessels > > et 2 matrices matPropVess et matInactivity de dimension annee, > strategie avec un fichier pour chaque annee qui contient un vecteur au > format semantics des strategies > > et 1 matrice de dimension annee, strategie, metier,mois avec un > fichier pour chaque annee-strategie qui contient un vecteur au format > semantics metier x mois > > Peux-tu m'aider ? > > Merci > > Stephanie > > > -- > ...................................................................... > Stephanie MAHEVAS > UMR MARBEC - site de Sète > IFREMER/HM > https://annuaire.ifremer.fr/cv/16343/ > > Tel: (33) 04 99 57 32 39 (8239) - 06 75 83 59 33 > > o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o > /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ > / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ > ...................................................................... -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS UMR MARBEC - site de Sète IFREMER/HM https://annuaire.ifremer.fr/cv/16343/ Tel: (33) 04 99 57 32 39 (8239) - 06 75 83 59 33 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

1 0

Import Target Factors
by aricouar April 24, 2023

April 24, 2023

Bonjour, Nous sommes encore bloqués avec l'importation des Target Factors. Contrairement à la précédente erreur qui correspondait à des noms de métiers dans la base qui ne correspondaient pas aux noms de métiers dans le fichier à lire, l'erreur actuelle fait intervenir un métier qui est bien présent et dans la base et dans le fichier myTFfile (ci-joint). Ci-joint également le message d'erreur obtenu, le debug et le script d'import. Après plusieurs essais, nous sommes parvenus à la conclusion que le problème se situait à la ligne 76 du script : double tf = matrixTargetFactors.getValue(metier, sp); Il ne parvient pas à récupérer la valeur de la matrice semantics qu'on lui demande de lire. Comment cela se fait-il ? Merci pour votre aide. -- Antoine RICOUARD\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\|/////// PhD student~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~/|\~~~ — @ — ~~~~ FREMER - PDG-RBE-MARBEC-LHM~~~~~~~~~~~~~~/_|_\~~~~/|\~~~~~ Station de Sète - Avenue Jean Monnet~~~~~\___/~~ ~~ ~~ CS 30171 - 34203 Sète Cedex~~~~ ~~~~ ~~~~ ~~~~ ~~~~ Tel.: 06.48.71.03.95 ~~~~~~~~ ~~~~~~ ~~~~~~~~~ Email: antoine.ricouard(a)ifremer.fr ~~~~~~~

3 13

Importation des TargetFactors
by Antoine RICOUARD April 20, 2023

April 20, 2023

Bonjour, Je cherche à importer des TargetFactors dans une base de donnée ISIS. J'utilise pour cela un script développé par Anh. Cela ne fonctionne pas. Ci-joint 1) le script java en question, 2) le rapport d'erreur de la dernière évaluation du script, 3) la région zippée que j'utilise. Voyez-vous où se trouve le problème ? Merci. Bonne journée, -- Antoine RICOUARD\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\|/////// PhD student~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~/|\~~~ — @ — ~~~~ FREMER - PDG-RBE-MARBEC-LHM~~~~~~~~~~~~~~/_|_\~~~~/|\~~~~~ Station de Sète - Avenue Jean Monnet~~~~~\___/~~ ~~ ~~ CS 30171 - 34203 Sète Cedex~~~~ ~~~~ ~~~~ ~~~~ ~~~~ Tel.: 06.48.71.03.95 ~~~~~~~~ ~~~~~~ ~~~~~~~~~ Email: antoine.ricouard(a)ifremer.fr ~~~~~~~

3 2

Import liste depuis un csv dans un script ISIS
by Antoine RICOUARD April 5, 2023

April 5, 2023

Bonjour, Ci-joint un script nommé 'ImportZoneMetierShapefile_sup12.java' qui sert à importer dans isis un shapefile associé à une zone_métier déjà créée (avec succès). Il s'agit en fait d'un script créé par Anh que j'ai modifié car le nom des shapefiles à importer n'est pas identique aux noms de la zone-métier que nous avons créé. Ces noms ont en effet changé au cours du processus de définition des métiers, si bien qu'ils ne correspondent plus aux noms des shapefiles. Pour y rémédier, je fais correspondre l'ancien et le nouveau nom de zone-métier en important deux listes correspondant aux anciens et nouveaux noms de métiers. Cet import est fait avec une méthode écrite par Anh dans le script 'PTAtoolbox.java' (ci-joint). J'ai utilisé avec succès cette fonction dans un autre script auparavant (pour créer ces zones-metiers) pourtant, il semble que l'utilisation de cette méthode génère à la compilation une erreur que je ne comprends pas : ---------- 1. ERROR in C:\Users\aricouar\Documents\MesProjets_local\ISIS_simul\isis-fish-4\isis-community-database\scripts\ImportZoneMetierShapefile_sup12.java (at line 82) List<String> zoneList_old = PTAtoolbox.readListTxt(myMetierListFile_old); // metiers avec nom format Anh ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ Unhandled exception type IOException ---------- 2. ERROR in C:\Users\aricouar\Documents\MesProjets_local\ISIS_simul\isis-fish-4\isis-community-database\scripts\ImportZoneMetierShapefile_sup12.java (at line 83) List<String> zoneList_true = PTAtoolbox.readListTxt(myMetierListFile_true); // metiers avec les noms metier_zone_fleet_isis_import ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ Unhandled exception type IOException ---------- 2 problems (2 errors) Comment faire ? Merci pour votre aide. -- Antoine RICOUARD\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\|/////// PhD student~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~/|\~~~ — @ — ~~~~ FREMER - PDG-RBE-MARBEC-LHM~~~~~~~~~~~~~~/_|_\~~~~/|\~~~~~ Station de Sète - Avenue Jean Monnet~~~~~\___/~~ ~~ ~~ CS 30171 - 34203 Sète Cedex~~~~ ~~~~ ~~~~ ~~~~ ~~~~ Tel.: 06.48.71.03.95 ~~~~~~~~ ~~~~~~ ~~~~~~~~~ Email: antoine.ricouard(a)ifremer.fr ~~~~~~~

2 2

Invitation et inscription - restitution projet MIMI - 12 & 13 avril - au Théâtre Universitaire de Nantes
by Stephanie MAHEVAS April 4, 2023

April 4, 2023

** *Cher.es toustes,* * Nous avons le plaisir de vous inviter à la restitution du projet MIMI <https://projet-mimi.fr/> (https://projet-mimi.fr/) un projet IFREMER art/science/société inédit, *le 12 avril ****de 9h30 à 19h45* *au Théâtre Universitaire de Nantes* (sur le campus universitaire, TU-Nantes, Chemin de la Censive du Tertre, 44300 Nantes). Il s’agit d’une grande journée “Pêche, Imaginaire et Incertitude” conviviale et pleine de surprises mêlant science et art. Le 13 avril de 18h à 19h45, 2 des performances artistiques seront à nouveau présentées au TU-Nantes Le programme précis de la journée, incluant les 5 performances artistiques, un atelier décalé et une émission de radio, est détaillé dans le flyer ci-joint. Nous vous remercions de remplir votre fiche d’inscription *avant le 5 avril *: **https://questionnaires.univ-nantes.fr/index.php/738247?lang=fr <https://questionnaires.univ-nantes.fr/index.php/738247?lang=fr> ** l’inscription est gratuite mais indispensable pour le repas et les pauses. La soirée se poursuivra au TU-Nantes pour ceux qui le souhaitent avec le spectacle Mer Plastique du chorégraphe Tidiani N'Diaye (réservation https://tunantes.fr) En espérant vous retrouver nombreuses et nombreux pour cette belle journée, Stéphanie Mahévas et Sophie Pardo pour l'équipe du projet MIMI * ...................................................................... Stephanie MAHEVAS UMR MARBEC - site de Sète IFREMER/HM https://annuaire.ifremer.fr/cv/16343/ Tel: (33) 04 99 57 32 39 (8239) - 06 75 83 59 33 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

1 1